غربالگری SNP های زیان آور در ناحیه ی کد کننده آنزیم کلیدی COX-2 دخیل در سرطان

Authors

  • محمدخانی, اشرف
  • نادری, الناز
Abstract:

  زمینه و هدف: امروزه، پلی­مورفیسم­های تک نوکلئوتیدی غیرمترادف (nsSNPs) ، که سبب تغییر در عملکرد پروتئین­ها می­گردند را بعنوان مارکرهایی در جهت شناسایی پروتئین­های درگیر در بیماری­های انسانی و سرطان­ها بکار می­برند.   روش کار: در این مطالعه، به جهت بررسی تأثیر عملکردی nsSNP ­ها در ناحیه­ی کدکننده­ی آنزیم COX-2 ، توالی نوکلئوتیدی این آنزیم از طریق پایگاه اطلاعاتی NCBI با رکورد (gi|223941909) به همراه تمام SNP های گزارش شده موجود (283 مورد) در این پایگاه برای سرطان­های مختلف جمع­آوری گردید و توسط سرور­های SIFT ، I-Mutant 2.0 ، SNP & GO ، PANTHER و FASTSNP مورد آنالیز قرار گرفت. این سرور­ها، ابزار­هایی در جهت پیش­بینی اثر جایگزینی­های اسیدآمینه­ی بر عملکرد، پایداری و قدرت بیماریزایی پروتئین­ها به حساب می­آیند.   یافته­ها: COX-2 آنزیمی اساسی در سنتز پروستاگلاندین­ها و بروز التهاب می­باشد که نقش آن در ایجاد و گسترش انواع سرطان به اثبات رسیده است. طبق نتایج بدست آمده در این مطالعه، همه­ی جایگزینی­های موجود در پایگاه اطلاعاتی NCBI سبب تغییر در عملکرد و پایداری پروتئین COX-2 نمی­گردد و برخی از جایگزینی­های اسیدآمینه ا­ی شامل R228H و S428A است که با ایجاد تغییر در عملکرد و پایداری پروتئین COX-2 بطور قطع می­توانند در ایجاد و گسترش بسیاری از انواع سرطان­ها نقشی اساسی را ایفا کنند.   نتیجه­گیری: جایگزینی­های اسیدآمینه­ی COX-2 بعنوان عامل بسیار مهمی در زمینه­ی�ابتلا به بیمار­ی های مختلف به ویژه سرطان­ها به شمار می­آیند. جایگزینی­های غیرمترادفی که در دومن کاتالیتیک رخ می­دهند به جهت تغییر در فعالیت آنزیم از اهمیت ویژه­ای نسبت به سایر نواحی برخوردارند و از آن­ها می­توان بعنوان مارکری مستقیم برای شناسایی هرچه سریعتر زمینه­ی ابتلا به بیماری­های مختلف استفاده نمود.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

اثر بربرین در تنظیم آستروسیتهای Gfap+ ناحیه هیپوکمپ موشهای صحرایی دیابتی شده با استرپتوزوتوسین

Background: Diabetes mellitus increases the risk of central nervous system (CNS) disorders such as stroke, seizures, dementia, and cognitive impairment. Berberine, a natural isoquinolne alkaloid, is reported to exhibit beneficial effect in various neurodegenerative and neuropsychiatric disorders. Moreover astrocytes are proving critical for normal CNS function, and alterations in their activity...

full text

حاملگی و تابشهای زیان آور

  Most women want to know about possible consequences radiology, radioisotope or even television terminal. Because knowing about them, prevent from fear. Fetus is inevitably placed to some types of radiation. Environmental radiation occurs from atmosphere, soil and buildings. Total radiation above, ingested and possibly inhaled radioisotopes probably is seventy five-thousandth to one-tenth of R...

full text

پاسخ و سازگاری آنزیم های COX-2 ، PGI-2 و TXA-2به تمرین مقاومتی فزاینده در رت های ویستار دیابتی

زمینه و هدف: شرایط التهاب مزمن در بیماری دیابت با بیان آنزیم سیکلواکسیژناز2 (COX-2) همراه است.از متابولیت های مهم این آنزیم که در هموستاز قلبی عروقی نقش مهمی دارند ، پروستاسایکلین (PGI-2)و ترومبوکسانA2(TXA-2)می باشد .هدف پژوهش حاضر مطالعه پاسخ و سازگاری آنزیم هایCOX-2 ، PGI-2 و TXA-2به فعالیت ورزشی مقاومتی فزاینده در رت های ویستار دیابتی است. مواد و روش ها: در مطالعه ای تجربی تعداد 49سر رت  وی...

full text

نقش مهارکننده‌های انتخابی آنزیم Cox-2 بر ژن HIF-1 alpha در سرطان کولورکتال: یک مطالعه In vitro

Background: Colorectal cancer is a major cause of morbidity and mortality throughout the world, and its treatments include surgery, chemo-radiotherapy. Despite improvements in clinical outcomes of patients with this tumor over the past decades, prognosis remains poor with a 5-year survival rate of <10%. Angiogenesis inhibitor agents have been recently added to the treatment regimen of this dise...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 13  issue 3

pages  305- 316

publication date 2013-09

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023